Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms