Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGR3Q8TD06 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms