Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms