Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms