Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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C9orf40Q8IXQ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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C9orf40Q8IXQ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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C9orf40Q8IXQ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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C9orf40Q8IXQ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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