Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms