Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms