Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms