Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms