Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WSCD1Q658N2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms