Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms