Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C10orf55Q5SWW7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C10orf55Q5SWW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C10orf55Q5SWW7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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