Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms