Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms