Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFB133Q30KQ1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB133Q30KQ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms