Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms