Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR2Q16832 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR2Q16832 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms