Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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