Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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