Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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