Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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