Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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