Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTTNQ14247 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms