Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms