Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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