Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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