Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPM6BQ13491 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms