Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms