Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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