Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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FOXI1Q12951 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FOXI1Q12951 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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FOXI1Q12951 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FOXI1Q12951 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXI1Q12951 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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