Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms