Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms