Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms