Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms