Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms