Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFC1-1P60608 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms