Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPAP53621 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPAP53621 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms