Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms