Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms