Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms