Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms