Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB2P29033 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB2P29033 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB2P29033 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms