Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms