Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms