Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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