Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA1P17302 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA1P17302 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms