Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAPBO95292 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAPBO95292 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms