Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DHHO43323 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DHHO43323 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHHO43323 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHHO43323 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms