Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP290O15078 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP290O15078 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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