Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
O00370 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
O00370 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
O00370 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
O00370 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms